明 清

明代

正德七年( 1512 )七月十九日，狼山山门及部分寺殿因明军攻歼刘七起义军遭火焚。

嘉靖十八年(1539 )创萃景楼。

嘉靖三十二年(1553) 葵竹山房始建。

嘉靖三十三年( 1554)后，倭寇屡犯狼山，祸及城乡。

隆庆六年( 1572 )前，狼山北观音禅院巳建。

万历二十七年(1599 )千佛寺创建。

万历四十六年(1618 )创文峰塔、五福寺。

崇祯元年( 1628)总兵王杨德捐资建军山普陀别院。

王杨德纂成《五山志》。

明隆庆三年，在寺后筑钟秀土山，山顶建碧霞元君阁，进士顾养谦、陈尧、袁随分别为寺立碑著记。

清代

顺治十八年(1661)清廷毁军山普陀别院及十六庵。

康熙十三年(1674)，狼山大雄宝殿后殿等改称紫琅禅院。

康熙二十二年(1683 )，重建军山普陀院大殿。

康照三十六年(1697 )狼山十一世祖冷山圆寂。

雍正二年(1724 )三仙祠创建。

乾隆十三年( 1748 )狼山重建碧云天半阁。立碑供康熙御制诗二首于内。

乾隆十六年( 1751)，闽人刘名芳编纂成《南通州狼五山全志》二十卷。

咸丰九年( 1859 )因黄朝飏农民起义事，请廷毁军山寺庙。

同治元年( 1862 )，军山妙持和尚因沙嫌农民军起义遭清延杀害。

光绪元年( 1875)，天宁寺六房公募兴修大殿、金刚殿及山门等。

光绪十二年( 1886)，狼山梵行庵僧近岸去京迎请大藏经《龙藏》回山，和《明藏》一起供奉于藏经楼上。

光绪十九年( 1893 )，天宁寺的大意堂松涛、水神殿柳堂、塔院六斋等募塑佛像，同时倡议整顿僧制庙规、上段、课诵、仪规等。

光绪二十五年( 1899)，狼山七庵卖庙田修支云塔，始向香客收“宝塔缘”。

光绪二十八年(1902 )千佛寺改为学校。

光绪三十二年( 1906 )，清政府向狼山寺院征税。是年，张謇集通海五属官绅议设学校，并将天宁寺东部毗卢阁、藏经楼等改建成公立学校。

光绪三十三年(1907 )通州南大街、东大街、西大街设立福音堂。